Pour chaque jeu de tirettes, une tirette constitue la fondamentale du son et les huits autres des harmoniques, tirez sur une drawbar et vous augmentez le volume d'une harmonique. Par exemple, pour la musique Rock, on utilisera souvent le réglage " Full Stops " ou 88 8888 888. Toutes les barettes sont alors tirées au maximum et le son est puissant. A contrario, on aura un son plus fin si l'on utilise ce réglage qui est un des standards en matière de Jazz : 88 0000 000. A noter que le son est modifiable en temps réel.

Le Hammond B3 dispose par ailleurs de 20 présets (ce sont les touches noires et blanches inversées à gauche de chacun des deux claviers) et de 4 présets réglabes (les La# et Si) grâce à 2 sets de 9 drawbars supplémentaires.

Il y a une grande variété d'effets intégrés (percussion, vibrato, chorus) ainsi qu'une pédale de volume. Outre, ces nombreuses qualités, le B3 à tout de même des défauts : son poids (400 pounds) qui le rend difficile à transporter et " le key clic " aléatoire, une sorte de " clic " dû à un contact électrique inopiné. Mais ce défaut est considéré de fait comme un des atouts majeur du Hammond B3 tant il rajoute à l'expression musicale un charme authentique, vivant.